为了搜寻9S，2B进入了之前探索过的地洞中。
只不过，这次她要去的是另一处通道。
开启金属闸门，乘坐电梯到达地底后，她来到了一条奇怪的街道——所有建筑都像没上色一样，呈现单调的黑白灰。
指挥系统分析，这里的场景，都是由一种碳和硅的结晶体物质所组成。
除此之外，它也无法提供更多的资料。
街道上散布着很多人工智能机器人的尸体。
据分析，应该是敌人故意搬过来，并布置成这样的。
顺着街道一直走到尽头后，达到一个宽敞的广场。
在这里银发男子亚当出现。
“他”研究了人类的行为模式后，发现人类的本质是斗争和杀戮。
至于机械生命体，通过网路联系在一起，完全是无敌的。
“他”感觉自己只是无止境的数据，没有活着的实感。
为了体验到死亡的概念，他主动与网路分离。
并且，通过虐待9S来激发2B的潜能。
最后，2B成功地将刀刺入亚当的腹部，斩杀了他。
可是，他最后的神情和话语却说明，他似乎很享受死亡所带来的乐趣。
2B救下了9S之后，交给阿妮摩尼。
后者表示，会将他送到寄叶总部修复。
2B感激地说了声“谢谢”，没想到，阿妮摩尼却感到非常意外。
接着，她又和总部的司令联系上。
司令分析过亚当，认为“他”负责管理机械生命体一半的网路。
“他”死亡后，机械兵肯定也会变得弱化。
至于9S，现在正进行数据翻新，很快将能和2B一起行动。
司令让她这段时间多关注一下机械生命体的动向。
结束通话后，2B联系了帕斯卡尔，获取相关信息。
对方表示，这两天它接触了一些和中央网络分离的机械兵。
它们打算缔结和平协议，而且还建立了一个聚居地。
帕斯卡尔希望2B可以陪它一同去谈谈。
她俩在之前的工厂大桥上汇合后，一同进入了废弃工厂里面。
这里的机械兵，都是一个叫做“教祖”的机械生命体的信徒，组建了一个信仰“神”的团体。
在祭司的引导下，2B和帕斯卡尔进入了教祖所在的神殿。
没想到，教祖此时却忽然归西。
在场的所有信徒们都以为教祖成神了，它们着了魔似的宣传成神的方法，打算带上2B和帕斯卡尔一起归西。
她俩只得进行反抗，伺机逃跑。
后面还遇到了一台由9S控制的机械兵，他会帮忙入侵工厂的系统，协助二人逃脱。
废弃工厂里面的地图极大，2B和帕斯卡尔跑了好久，才到达一个仓库中。
在这里遇见了关卡头目——一个巨型蜘蛛机器人。
干掉它之后，二人搭乘电梯前往工厂出口。
路上看见了不少信徒跳入冶炼炉内——它们认为这是成神的仪式。
此时，剧情切换到另一边：
人造人夏娃得知“他”的哥哥-亚当逝世后，愤怒地要杀光地球上所有生命体。
而且，“他”的一半身体开始被感染变黑。
2B和帕斯卡尔冲出工厂后，接到阿妮摩尼的通信：
营地突然间遭受了大量机械兵的袭击，需要支援。
2B赶过去后，惊讶地发现，机械兵在吃人工智能机器人。