探险队进入门内后，发现这里是一个巨大的实验室，中央摆放着一个巨大的培养皿，培养皿中充满了绿色的液体，液体中浸泡着一个人形生物，它的身体上布满了奇怪的纹路和凸起，仿佛是各种生物特征的拼接。周围的仪器设备上显示着各种复杂的数据和图像，这些信息表明这个生物就是神秘组织实验的最终产物 —— 超级生物兵器的雏形。
“这就是他们想要制造的怪物吗？太可怕了。” 苏瑶医生看着培养皿中的生物，不禁打了个寒颤。
林宇在实验室的操作台上找到了一份详细的实验报告，报告中详细记录了这个超级生物兵器的设计理念、功能以及制造过程中的问题。原来，这个生物兵器被设计成不仅具有超强的攻击力和防御力，还能够传播一种特殊的病毒，这种病毒能够迅速将人类转化为丧尸，并且让丧尸受神秘组织的控制。
“如果这个东西被制造成功并投入使用，那世界就真的完了。” 林宇面色阴沉地说道。
就在这时，实验室的灯光突然变成了红色，警报声再次响起。“不好，他们启动了自毁程序！” 墨尘喊道。
“我们必须阻止自毁程序，同时销毁这个生物兵器的雏形，不能让它继续存在。” 林宇当机立断。
队员们开始在实验室中寻找自毁程序的控制终端。在紧张的搜索过程中，敌人再次出现。这次出现的是一群机械傀儡，它们身形巨大，由金属打造而成，每一步都在地面上留下深深的脚印。它们的手臂可以变形为各种武器，有的是锋利的刀刃，有的是发射能量弹的炮管。
“大家小心，这些机械傀儡不好对付！” 张阳提醒道。他率先冲向一台机械傀儡，高高举起斧头，朝着傀儡的腿部砍去。斧头与金属碰撞，溅起一片火花，但傀儡只是微微晃动了一下。
其他队员也纷纷与机械傀儡展开战斗。叶璃灵活地穿梭在傀儡之间，利用双刀寻找傀儡的关节等薄弱部位进行攻击；墨尘则在一旁指挥，同时用手枪射击傀儡的眼睛等关键部位；苏瑶在战斗间隙照顾受伤的队员，并为他们提供一些辅助攻击。
林宇在与一台傀儡战斗的同时，还在寻找自毁程序的线索。他发现自毁程序的控制终端在实验室的一个高台上，需要先解决周围的傀儡才能到达。
在激烈的战斗中，探险队逐渐摸清了机械傀儡的攻击模式。他们相互配合，有的吸引傀儡的注意力，有的则趁机攻击。经过一番苦战，终于将所有的机械傀儡都破坏掉。
林宇迅速爬上高台，来到自毁程序的控制终端前。终端上显示着倒计时，只剩下不到两分钟的时间。林宇凭借着自己对电子设备和程序的了解，开始尝试破解自毁程序。
在倒计时还剩三十秒的时候，林宇终于成功地停止了自毁程序。“太好了！” 队员们欢呼起来。
但他们还没来得及高兴，培养皿中的生物兵器雏形突然有了动静。它似乎被战斗的动静唤醒，绿色的液体开始翻滚，它的眼睛缓缓睁开，透露出一股邪恶的气息。
“它要苏醒了！” 林宇大喊道。
队员们立刻将注意力转移到生物兵器上。他们知道，必须在它完全苏醒之前将其消灭。他们集中所有的武器，朝着培养皿中的生物兵器开火。能量束、子弹如雨点般射向生物兵器，但它的皮肤异常坚韧，普通的攻击只能在它的体表留下一些浅浅的痕迹。
“攻击它的头部和心脏部位，那里应该是它的弱点！” 墨尘喊道。
队员们调整攻击方向，朝着生物兵器的头部和心脏部位集中火力。在强大的火力攻击下，生物兵器受到了重创，它开始疯狂地挣扎，培养皿也因为它的剧烈动作出现了裂缝。
“继续攻击，不能让它出来！” 林宇喊道。
在最后一轮猛烈的攻击下，生物兵器终于停止了挣扎，彻底被摧毁。培养皿中的绿色液体流了一地，散发出刺鼻的气味。
“我们成功了！” 队员们激动地拥抱在一起。他们不仅阻止了自毁程序，还销毁了超级生物兵器的雏形，避免了更大的灾难。
这次探险，让他们彻底了解了瘟疫和丧尸化生物的根源，也让他们意识到，神秘组织虽然遭受了重创，但他们的威胁依然存在。
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