在成功抵御“熵能风暴”之后，联合舰队在这个神秘星系稍作休整，继续踏上了充满未知的征程。
他们来到了一个被称为“镜像宇宙”的奇异空间。在这里，所有的物质和现象都与他们所熟悉的宇宙呈镜像对称，物理规律也发生了奇特的变化。
联合舰队的战舰在这个诡异的空间中小心翼翼地前行，却发现自己的行动变得异常艰难。原来，镜像宇宙中的引力和电磁力的作用方向与常规宇宙完全相反，导致舰队的引擎和仪器频繁出现故障。
为了适应这个特殊的环境，联合舰队的科学家们日夜不停地进行研究和实验。他们最终开发出了一种能够根据环境自动调整物理参数的装置，使得舰队能够在镜像宇宙中正常航行。
然而，新的危机接踵而至。镜像宇宙中存在着一种名为“幻影生物”的神秘种族，它们能够利用镜像空间的特性隐藏自己的身形，然后出其不意地对联合舰队发动攻击。
这些幻影生物的攻击方式极为独特，它们可以直接穿透战舰的护盾，对舰内的人员和设备造成伤害。联合舰队在最初的遭遇战中遭受了不小的损失。
在经历了几次挫折之后，联合舰队的指挥官们制定了一套全新的作战策略。他们利用战舰上的特殊传感器来捕捉幻影生物的能量波动，然后通过精确的火力打击将其消灭。
经过一场激烈的战斗，联合舰队终于成功击退了幻影生物的攻击，继续深入镜像宇宙进行探索。
在镜像宇宙的核心区域，联合舰队发现了一个巨大的能量源。这个能量源散发着强大的力量，似乎是维持镜像宇宙存在的关键。
但就在他们准备对能量源进行研究时，一个强大的外星势力突然出现。这个势力自称“守护者”，他们宣称这个能量源是镜像宇宙的神圣之物，任何试图接近它的人都将被视为敌人。
联合舰队试图与“守护者”进行和平谈判，但对方态度坚决，毫不留情地对联合舰队发动了攻击。
联合舰队不得不奋起抵抗，双方展开了一场激烈的太空激战。“守护者”的战舰装备精良，拥有强大的火力和先进的防御系统。
但联合舰队凭借着顽强的战斗意志和出色的战术配合，逐渐在战斗中占据了上风。
就在联合舰队即将取得胜利的时候，“守护者”启动了一个巨大的能量装置，引发了一场空间乱流。
联合舰队的战舰在乱流中被不断地拉扯和扭曲，形势变得岌岌可危。关键时刻，联合舰队的科学家们利用他们对镜像宇宙的研究成果，找到了稳定空间的方法。
最终，联合舰队成功摆脱了空间乱流，击败了“守护者”。但他们也意识到，这个神秘的镜像宇宙中还隐藏着许多未知的危险和秘密。
离开镜像宇宙后，联合舰队又收到了来自一个遥远星球的求救信号。这个星球正遭受着一种名为“纳米瘟疫”的灾难。