水运
阿富汗北部同乌兹别克斯坦和土库曼斯坦边界上的阿姆河和昆都士河部分河段有通航能力。20世纪50年代，苏联帮助阿富汗在阿姆河上修建了 3个港口，分别是谢尔汗班达尔港，塔什葛扎尔港和达格拉罗萨港。其中，谢尔汗班达尔港最重要，70年代初，这个港口曾得到扩建。据美国中情局估计，2001年，阿富汗水运线总长约1200公里。
空运
阿富汗目前有两家航空公司。阿利亚纳航空公司实力较为雄厚，主要经营国际航线。目前已开通至巴基斯坦、伊朗、阿联酋、印度、土耳其、德国、俄罗斯、阿塞拜疆、沙特、科威特和塔吉克等12条国际航线，2003年7月12日正式开通喀布尔至乌鲁木齐航线。KAM航空公司经营国内航线。全国有机场46个，喀布尔机场为国际机场。
阿富汗16条国际航线包括：乌鲁木齐、迪拜、德里、杜尚别、德黑兰、马什啥德、伊斯兰堡、白沙瓦、吉达、法兰克福、伊斯坦布尔、科威特、莫斯科、安卡拉、沙加、巴林。
其中中国商务人员最常用的空中路线有以下几条：
A.北京-伊斯兰堡-喀布尔航线。
在北京还无法购买联程机票，因此旅客一般要到伊斯兰堡后再购买去喀布尔的机票=从伊斯兰堡去喀布尔的飞机主要有二家：
巴基斯坦国际航空公司，每周一、四下午1: 00左右飞喀布尔，费用为210美元/人。阿富汗阿里亚娜航空公司，每周日下午1: 00左右飞喀布尔，费用为150美元/人。另外联合国也有定期航班飞喀布尔，但一般乘客无法买到。国内官方代表团可请中国使馆协助。
巴航飞机比较可靠，但乘客较多，票价也稍贵。阿航票价虽然便宜，但因飞机较旧及乘客不多，经常临时取消。乘客在伊斯兰堡期间，注意要反复询问相关航空公司代理，以确认准确航班起飞时间。
B.北京-乌鲁木齐-伊斯兰堡-喀布尔航线
中国南方航空公司每周三和周日有固定航班飞伊斯兰堡。其后可接巴航或阿航到喀布尔。
c.北京-乌鲁木齐-喀布尔航线
阿富汗阿里亚娜航空公司开通了从喀布尔到乌鲁木齐的航班，每周二往返一班。往返票价为420美元。同其他航线相比，这条路线最为便捷，省时省钱。只是阿航飞机一向以不守时闻名，按时起飞的次数不多，乘坐此航班的人士要有思想准备。
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