公路
据秘鲁交通通信部统计，2018年秘鲁公路总里程公里。其中，沥青路公里，包括国道公里，省道3623.1公里，市镇级公路1858.9公里。秘鲁共有约300公里的高速公路，主要集中在从首都利马向泛美公路南北两端延伸的部分路段。秘鲁的主要公路是纵贯南北的泛美公路、山区纵向公路、横跨东西的中央公路、南美地区一体化公路（IIRSA）。目前，秘鲁的公路营运权大部分已售出。
水运
秘鲁濒临太平洋，内陆河网纵横，水陆交通条件较好。秘鲁共有85个港口，其中海港58个、河港24个、湖港3个，共有103个码头，水运比较发达。但是随着秘鲁经济连续多年快速增长，对外贸易规模大幅提高，其现有港口能力越来越难以满足需求。
根据秘鲁国家港务局 (APN) 的数据，2019 年公共港口码头吞吐量约为5300万吨，比2018年增加2%。最主要的港口是与首都利马毗邻的卡亚俄港，这是南美地区太平洋沿岸最重要的港口，已交私营部门特许经营，包括北部、南部和矿产品三个码头，分别属于马士基（APM）、迪拜国际（DPW）和卡亚俄运输公司，设备先进，管理规范，现代化程度较高。2019年，卡亚俄港的货物吞吐量占全国总量的71%。其他重要海港还有派塔（Paita）、巴约瓦尔（Bayovar）、萨拉维利（Salaverry）、钦博特（Chimbote）、皮斯科（Pisco）、伊洛（Ilo）、马塔拉尼（Matarani）等，河港中比较重要的是伊基托斯（Iquitos）。
【中远海运港口秘鲁钱凯项目】
2019年1月23日，中远海运港口与秘鲁火山矿业在达沃斯论坛期间签署秘鲁钱凯项目的认购及投资协议。中远海运港口以2.25亿美元向火山矿业收购秘鲁钱凯码头 (Terminales Portuarios Chancay S.A.) 60%的股权，首期付款为5600万美元。
2019年5月13日，中远海运港口秘鲁钱凯项目正式交割。秘鲁钱凯项目位于秘鲁中部，交通便利，地理位置重要。项目包括多用途码头、集装箱码头及相关的基础设施。建设规划一期建四个泊位，包括两个多用途泊位和两个集装箱泊位，设计年吞吐量为100万标准箱。项目计划于2022年完成，建成后的钱凯港将成为南美洲大陆的重要枢纽港、太平洋沿岸的物流中心。
空运
秘鲁位于南美洲中部，濒临太平洋，是南美地区空运的枢纽。秘鲁共有134个机场，其中72个为民用机场。国际机场11个，国际航线可通往美国多个城市、欧洲部分国家和拉美各主要国家。最主要的国际机场有位于首都利马的豪尔赫·查维斯机场和阿雷基帕、奇克拉约、伊基托斯、库斯科机场等。国内机场13个，其余的为地区性机场。
目前秘鲁约70个机场属国家所有，其中有18个已交由私营部门特许经营，29个由国有的CORPAC公司经营。2001年，首都利马的豪尔赫·查维斯机场出售给法兰克福机场管理公司，经营管理水平得到极大提高，2009—2018年连续10年当选南美最佳机场，2018年在全球排名第49位，比2017年上升6位。