1757年，为制止殖民地总督威廉·宾的儿子的不法行为，已经51岁的富兰克林又代表宾夕法尼亚人到伦敦向英王请愿。自此在英居住五年，期间写文章，造舆论，向英国人民及政府官员阐述了殖民地的状况和意见，致使斗争取得了部分成功。牛津大学因为他在科学上的成就，在这段时间颁赠他荣誉博士学位。
富兰克林的后半生主要从事外交活动。55岁那年，他准备退出政坛，悉心研究科学，但是宾夕法尼亚立法机关派他去伦敦解决一起有关土地征税的争端。当时佩恩家族拒绝为他们占有的大片土地缴税。富兰克林离开数年。当他返回美国时，正值费城进行州议会选举，他于1764年5月被选为宾夕法尼亚州议会议长(任期至此年10月) 。在这之前，他已经多年担任州议会的议员(1751-1757，1762-1764 ?)，但这一次他却落选了，因为佩恩家族极力要毁掉他的政治前途。富兰克林和其他人决定向英王请愿，把宾夕法尼亚变成英国的直辖殖民地，从而永久地剥夺佩恩家族的控制权。尽管已经不是议员，可州议会还是委托富兰克林前往英国交涉，这次旅程历时达10年之久。在美国，宾夕法尼亚又陷入了另一场纠纷中。
1765年英国议会通过一项法案，要对殖民地的各种印刷品征税，由于付税凭证是一枚印花，因此这一法案被称为《印花税法案》。在英国本土早就开始征收相似的税种，富兰克林几年前也曾提出这一建议。但是1765年的政治气氛已经发生变化。《印花税法案》在美国街头引起了骚乱，民众纷纷发表激烈的反对演讲，斥责这一专制行为。由于当时富兰克林的儿子威廉已经担任了新泽西州的州长，所以不少人认为富兰克林是《印花税法案》的罪魁祸首之一。在费城富兰克林位于市场街的寓所，他的妻子德博拉由于害怕民众的愤怒情绪爆发甚至为自己配备了手枪。
富兰克林在开始时态度比较温和，主张维护英国的权威。表现出他在那时反对英国殖民统治的思想很不彻底。这在1760年他写的《大不列颠利益的考虑》一文中，清楚地暴露出来。另一方面，由于身在英国，他不知道家乡人民对印花税的反对是多么激烈，后果如何严重。
在6个星期后，他终于得知了同胞反对印花税的消息。富兰克林预感到革命风暴的来临，于是，他站在人民的立场上，于1766年2月13日在英国下议院论述废除《印花税法案》的理由。在长达4小时的时间里，面对着众位议员，富兰克林答复了174个问题。后来英国哲学家埃德蒙·伯克描述了这场戏剧性的答辩，说那就像是一位大师在回答一群学生的提问。富兰克林提醒议会，美国人一直把自己视为英国人，只要他们受到尊重就会一如既往地支持英国。几星期后《印花税法案》被废除。富兰克林在这次斗争中发挥了一定作用。美国人把富兰克林视为英雄。
但是英国并没有放弃向殖民地征税的想法，不久新税种又出现了。为了强制征税，英国甚至派遣部队进驻美国，费用自然由殖民地居民承担。局势再度紧张。富兰克林预料形势将会恶化，一场殖民地居民和英国人之间的战火即将点燃。1773年12月16日，波士顿人和英国士兵之间发生了口角，双方先是互掷雪球，结果最后冲突发展过大致5人丧生。波士顿人被激怒了，他们将600磅的英国茶叶倒入港口(波士顿倾茶事件)。几年前美国人几乎不会想到"独立"这种字眼，但这时宣告独立似乎成为唯一可行的办法。富兰克林一直希望不要出现这样的局面。
1770年，马萨诸塞州聘请效忠英国的富兰克林担任驻伦敦代表 ，但州长托马斯·哈钦森却否决了这项任命。当时富兰克林断言，派遣更多的英军去波士顿，只能证明英国对殖民地的敌意，后来他获知这些部队都是哈钦森要求部署的。哈钦森曾多次写信给英国的官员，批评马萨诸塞州的局势，并建议剥夺殖民地区所谓的英国式自由。
两年之后，也就是1772年，这些信件传到了富兰克林手中。他把它们交给马萨诸塞的朋友看，请他们在殖民地官员中秘密传阅，但不要公开。他的这种要求显然过于天真，结果这些信件被公开出来，自然引起了一场轩然大波。愤怒的波士顿人写下请愿书，要求罢免哈钦森，让富兰克林代表他们向英王请愿。富兰克林接受了这项使命。而哈钦森则要求扞卫他的名誉。这件事传到伦敦后也引起了一场混乱，英国人想弄明白究竟是哪个叛徒把这些私人信件交到了殖民地居民的手中。他们排出了几个可疑分子。富兰克林自然不希望暴露自己。但当他的一位朋友也被列为嫌疑人时，富兰克林感到自己有必要站出来承认是他公开了这些信件。
1774年1月11日，在富兰克林68岁生日前6天，他接到一份来自伦敦枢密院的邀请。邀请信措辞友好，富兰克林以为枢密院将考虑接受民众的请愿，请他接替哈钦森州长的职务。但是3个星期后，当富兰克林走进枢密院时才发现他要面对的是有关泄露哈钦森信件的调查。枢密院里坐满了议员和旁听者，高尔勋爵主持听证会。在一个半小时的时间里，富兰克林站在那里接受副检察长韦德伯恩的训斥。热衷辱骂的韦德伯恩是个苏格兰人，他对富兰克林进行了肆意恶毒的人身攻击。听证会结束后，富兰克林镇静地走了出来，一语未发。过去富兰克林的殖民地同胞批评他过于倾向英国，而英国人却谴责他过于美国化。
同年，英国政府颁布了五项苛刻法令，统称为"强制法案"(Coercive Acts)，殖民地人称"不可容忍法令"(Intolerable Acts)。同时，英国封锁波士顿港口，增派军队，加强了对北美殖民地的军事镇压。这一切使富兰克林十分愤慨。他在1775年初向英国呈交了《调回驻波士顿军队的方案》，但被拒绝。英国政府日益憎恨富兰克林，使他的处境极端困难。
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