塞琉古帝国的最终崩溃使庞培于公元前64年吞并了叙利亚（Syria），但其解体却使该地区动荡不安，许多城市趁机实现了独立。
公元前63年初，庞培离开安条克（Antioch），向南进军，先后占领了阿帕梅亚（Apamea）等沿海城市，随后越过黎巴嫩山脉，占领了佩拉（Pella）、约旦（Jordan）和大马士革（Damascus）。
庞培进一步南下进入犹太（Judea），是因为在希尔卡努斯二世（Hyrcanus II）和阿里斯多布鲁斯二世（Aristobulus II）的领导下，当地居民侵袭了腓尼基（Phoenicia），庞培希望制止这种情况。
初次进攻因哈斯蒙尼安内战（Hasmonean Civil War）而受到干扰，庞培支持希尔卡努斯二世对抗他的兄弟阿里斯多布鲁斯二世。
当他迫使阿里斯多布鲁斯二世投降耶路撒冷（Jerusalem）时，其防御者逃入圣殿（Temple），罗马军队首先攻入圣殿，随后进行了洗劫。
犹太成为由希尔卡努斯统治的附属王国，其北部地区则被并入十城联盟（Decapolis），这是一个由半自治城市组成的联盟。
犹太和这个联盟均成为新成立的叙利亚省（Syria）的附属。
其他组织变革包括设立比提尼亚（Bithynia）和本都省，米特里达梯的其他领土则分配给罗马盟友。
此外，卡帕多西亚（Cappadocia）的阿里奥巴尔扎涅斯一世（Ariobarzanes I）被恢复到王位，而小亚美尼亚则从提格兰手中夺走并并入加拉太（Galatia），庞培的盟友德约塔鲁斯（Deiotarus）成为新王国的统治者。
最后，奇里乞亚（Cilicia）获得了帕夫菲利亚（Pamphylia）的沿海地区，此地曾是海盗的中心，以及其他内陆地区，并重新组织为六个部分。
这些措施显着增加了罗马的收入，为庞培提供了多种机会来增加个人财富和赞助基础。
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在公元前62年回到意大利之前，庞培向他的军队支付了总计约16,000塔兰特（talents）的奖金，尽管人们担心他打算效仿苏拉，但他们在布伦迪西姆（Brundisium）抵达时被解散。
庞培的回程在每个停靠的地方都吸引了大量人群，显示出尽管参议院的意见分歧，庞培在大众中的人气依然如故。
他因在小亚细亚的成就被授予第三次凯旋式（triumph），这一荣誉在公元前61年他的45岁生日庆祝。
庞培声称，在东方设立的新省份使年国家收入从2亿增至3.4亿塞斯特斯（sesterces），此外还向国库额外支付了4.8亿塞斯特斯。
他拒绝提供个人财富的详细信息，但考虑到公开声明的金额，这必定是巨大的。
其中一部分用于建造古罗马最着名的建筑之一——庞培剧院（Theatre of Pompey）。
然而，参议院随后拒绝批准庞培在处理东方事务时达成的条约。
反对的主要力量是保守派（optimates）凯托二世（Cato the Younger）和梅泰鲁斯·塞勒（Metellus Celer），他们的姐姐穆基亚（Mucia）最近与庞培离婚，离婚原因仍有争议。
他们还否决了一项将土地分配给庞培退伍军人和无地城市贫民的法案。
类似的措施在公元前63年被拒绝，或许使得参议院对控制民众不满的能力过于自信。
虽然庞培无法单独克服保守派的反对，但局势在公元前59年马略（Marius）的侄子尤利乌斯·凯撒（Julius Caesar）寻求他的支持竞选执政官时发生了变化。