通过报纸的宣传，天下人都知道了获得丹书铁劵的人是谁，也知道了王承恩和史可法的功劳。将来如果皇帝无辜诛杀他俩，就要遭到天下人的唾骂了。
这算是杨毅给自己套上的一个紧箍咒，目的就是为了笼络人心。
解决了丹书铁劵的事之后，经过一个多月的审讯，朱由崧、朱国弼、刘孔昭等叛乱的首犯全部按谋逆罪被判斩立决。
按古代律法，谋逆大罪是要被判诛九族的，但杨毅来自后世文明世界，对这种判罚有些不适应。他觉得一人做事一人当，有造反事实的人砍了就算了，株连九族的话，太不人道了。
于是，在杨毅的干涉下，大理寺只对朱由崧等直接参与叛乱的人判处了死刑。
但是，在封建社会这种文化背景下，对谋逆叛乱的人只砍首犯，亲属一点都不牵连的话，又显得太宽宏大量了。
造反失败只是自己被砍头，又不牵连子孙后代等亲属，就显得造反成本太低。杨毅怕所有人都争相造他的反，那就忙不过来了。
最后，杨毅还是指示大理寺，对这些叛乱的王公贵族三族以内的直系亲属，判处了终生监禁，永不赦免。当然，监禁期间是要进行劳作的，不然官府哪有那么多闲钱闲粮来养他们啊。
而如果试图越狱，或者攻击警卫的话，就要罪加一等，直接砍头了。
如此，江南各省王公贵族在大顺朝廷奸细挑拨下进行的谋逆叛乱算是彻底平定了。
然而，就在江南各省的王公贵族叛乱被大明朝廷平定的时候，在无人注意的西南边陲，却开始暗流涌动起来。
位于云南省中北部、紧邻昆明的武定府境内，金沙江边上的元谋县，是由当地土司吾必奎出任的知县。
因为明末中原战乱，大明朝廷对西南边疆的控制力薄弱得很。为了节约兵力粮饷，大明朝廷采取了以夷制夷的政策，让当地少数民族首领，也就是土司，来出任当地知县，以此控制边疆地区。
但是，这个政策只是大明朝廷的一厢情愿罢了。
比如元谋土司吾必奎，他就是一个很有野心的人。出任元谋知县后，吾必奎就以官方的名义，攻打吞并了境内数十个山寨，拥兵上万，在元谋县称王称霸。
在原来的历史上，崇祯帝自缢的消息传来后，吾必奎说：皇帝都死了，哪还有什么大明朝廷，我自己当皇帝得了。
于是，趁中原战乱不断，各方势力都无法管理西南的时候，吾必奎毅然起兵造反。然后，他在很短时间内就攻陷了武定府、姚安府和楚雄府境内的定远县，云南全省震动。
镇守云南的当代黔国公沐天波急忙调集各地土司，一同围剿吾必奎。一个月后，吾必奎战败，被活捉处死。但是，跟随沐天波平叛的临安土司沙定洲，却赖在昆明不走了。
沙定洲是云南省东南部临安府蒙自县的土司，同样因为大明朝廷以夷制夷的政策，被任命为蒙自县的土知县。其妻万氏是临近的阿迷州（今开远市）土司普名声之妻，普名声死后，万氏改嫁给了沙定洲。沙普合流，实力剧增，称霸临安府。
在崇祯十七年左右，沙定洲已经实际控制了临安府的大部分县，包括蒙自县、阿迷州、安南司、新安所、王弄山司，拥兵2万余人。