随着匈牙利与奥斯曼帝国关系恶化，苏莱曼重新发起了在中欧的战役，并在1526年8月29日，在莫哈奇战役（Battle of Mohács）中击败了匈牙利国王路易二世（Louis II，1506–1526年）。
据说，当苏莱曼看到路易国王的尸体时，感叹道：“我确实是带着武器而来，但我并不希望他在还未真正享受生命和王权的甜美之前就这样被终结。”
当苏莱曼在匈牙利作战时，安纳托利亚中部的土库曼部落（Turkmen tribes）在卡兰德尔·切莱比（Kalender ?elebi）的领导下发生了叛乱。
一些匈牙利贵族提议让费迪南德（Ferdinand），即邻近奥地利的统治者，并通过婚姻与路易二世的家族有联系的人，成为匈牙利的国王，理由是根据先前的协议，如果路易二世无子嗣，哈布斯堡家族将继承匈牙利王位。
然而，另一些贵族则转向了受到苏莱曼支持的贵族约翰·扎波利亚（John Zápolya）。
在查理五世和他的兄弟费迪南德一世的领导下，哈布斯堡家族重新占领了布达（Buda）并控制了匈牙利。
对此，苏莱曼在1529年率军穿过多瑙河谷，重新控制了布达。
同年秋天，他的军队围攻了维也纳。这是奥斯曼帝国最具雄心的远征，也是其西进的巅峰之作。
奥地利方面拥有16,000人的增援驻军， 并在维也纳给予苏莱曼第一次失败，从而播下了奥斯曼与哈布斯堡家族的长期宿怨，这场宿怨一直持续到20世纪。
苏莱曼第二次攻打维也纳的尝试在1532年失败，因奥斯曼军队被围攻圭恩斯（Güns）耽搁，未能抵达维也纳。
在这两次情况下，奥斯曼军队都受到恶劣天气的困扰，不得不遗弃重要的围攻装备，并因过度拉长的补给线而受到限制。
1533年，费迪南德一世签署了《君士坦丁堡条约》（Treaty of Constantinople），承认奥斯曼帝国的宗主权，承认苏莱曼为其“父亲和宗主”，并同意每年向奥斯曼帝国进贡，还接受了奥斯曼帝国大维齐尔与他平等的地位。
匈牙利国王约翰·西吉斯蒙德（John Sigismund of Hungary）于1556年与苏莱曼会面。
到1540年代，匈牙利的冲突再次爆发，给了苏莱曼报复在维也纳失败的机会。
1541年，哈布斯堡家族试图围攻布达，但遭到击退，奥斯曼帝国在1541年和1544年连续两次战役中占领了更多哈布斯堡家族的堡垒，费迪南德和查理被迫与苏莱曼签订了一项屈辱的五年条约。
费迪南德放弃了对匈牙利王国的主张，并被迫每年向苏丹支付固定金额以维持他继续控制的匈牙利领土。
更具象征意义的是，条约中称查理五世不是“皇帝”，而是“西班牙国王”，这使得苏莱曼自认为是真正的“凯撒”。
1552年，苏莱曼的军队围攻了位于匈牙利王国北部的埃格尔（Eger），但由伊什特万·多博（István Dobó）领导的守军击退了攻击并成功保卫了埃格尔城堡（Eger Castle）。
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