碇真嗣现在的问题就是父母的不和的问题，他们的目标相差太远了，碇唯惦记的不是自己的幸福，而是全人类的机会。而碇源堂就想着自己，连儿子都顾不上。
由《人类补完计划》衍生出来的三大派系，一seele为引导的补完派，二以碇唯为核心的选择改良派，三碇源堂的篡夺派。当然后来还有以葛城美里为核心的反对派，她想要阻止补完计划，维持现状。
一个计划就能衍生出四个不同的选择，可以说是君子和小人的大决战了。君子和小人并不在才华、天赋、知识、手段等方面有差距，只是在立场上有差距。
所以站在各自的立场上来看自己都是君子，对方才是小人。
当两个完全相反的立场出现，可能是一个对，也可能两个都错。因为不能两个全对，所以只能不断厮杀。
剧场版最后葛城美里一方对碇源堂一方的战斗，就是计划篡夺派对反对派的对决。seele代表的计划原教义派一早就被碇源堂给踢出了计划，早早就被消灭了，也是呜呼哀哉。
而碇唯所代表的选择改良派是静观其变，反正待在初号机里就能保护最后的选择。就算真的发生了补完，只要初号机驾驶员还活奔乱跳就还能重新开始。
所以人类的争斗真的是不可避免，一件事情就能冒出四个立场，甚至一家人都能站在对立面。每次遇到这种事情，杜兰都会很高兴，是深怕他们不能互相伤害。一家人因为吸引而走到一起，又因为立场而对立，人的多样性莫过于此。
不过对碇真嗣而言，这肯定不是什么幸福的事情，父母因为各自立场对立，自己作为儿子就很尴尬了。只能说有这样的父母，碇真嗣应该早点成长和接受。可惜他身边全是谜语人，一个个都不愿意好好说话，更不会让他知道自己父母的目标。
杜兰也不去管碇源堂现在还想要故技重施，反正该说的他都说了，碇源堂既然还想继续这么做，那么杜兰能做的也只能不断提升碇真嗣还有碇唯的实力。
能力越大，责任越大，碇唯的责任越大，她肯定会越来越远离碇源堂的，她不会停下来，会不断向前。碇源堂如果追不上，那也只能望尘莫及。
碇源堂从姓氏来看就知道他是入赘的，因为一般来说岛国夫妻结婚，妻子要随丈夫的姓氏。但现在却反过来了，丈夫随妻子姓，只有在妻子地位远高于丈夫的时候才会如此。入赘，就说明了碇源堂没什么自主性，是依附碇唯的，所以他只能去追碇唯，但他的老婆那么优秀，总是先他一步。
有杜兰的帮助，初号机里的碇唯实力不断提升，有一种得道飞升的感觉。
“你对碇唯做了什么？”碇源堂本来还想悄悄地和碇唯见面，却发现碇唯的灵魂好像消失了一样，不是从初号机里消失了，好像是从宇宙里消失了，他感觉不到了。以前不管他和碇唯相隔多远，他都能感受到妻子在等他重逢，但现在这种感觉没有了。