【明太宗朱棣还完善了明朝的文官制度，为后来明朝的内阁制度奠定了基础。
由于朱元璋废除了丞相制度，皇帝直接领导六部，故而导致皇帝的政务压力达到极点，朱棣登基后设立内阁制度，内阁品级不高，一般要经过翰林院庶吉士锻炼。
永乐时期内阁文臣只是正五品，从职权来看，也只是顾问，供皇帝咨询国家大政方针的制定和决策，充当皇帝智囊团的角色。
内阁的出现弥补了中书省废除后，中央机构在结构上的脱节。
正统后，内阁中枢决策的权位愈发巩固，权力也开始超过六部，内阁首辅开始出现，其地位与作用也日益显着。
而明朝三大才子的解缙也被任命为内阁第一任首辅，以下便是朱棣时期的内阁阁臣名单：解缙、黄淮、胡广、胡俨、杨荣、金幼孜、杨士奇，杨溥。
此外，朱棣还启用了朱元璋后来废除的锦衣卫制度，锦衣卫的职权在明宪宗成化年间基本发展成熟，缉捕谳狱及城市管理是锦衣卫堂官的首要职掌，侍卫皇帝则居次要地位。
为了遏制锦衣卫的权力，又增设了东厂即东缉事厂，中国明代的特权监察机构、特务机关和秘密警察机关。
东厂权力在锦衣卫之上，只对皇帝负责，不经司法机关批准，可随意监督缉拿臣民，从而开明朝宦官干政之端。
厂卫制度是明朝时期的反贪局和国家安全局、情报局；和勋贵系统一样，是明朝皇帝用于压制明朝文官势力的重要组成部分。
然而在土木堡之战之后，明朝勋贵凋零，厂卫系统也遭受严重损失，再也无力压制日益庞大的文官利益集团，尽管后面几位明朝皇帝努力恢复厂卫，但由于勋贵系统缺失，无法像以往那样严密监视文官集团，导致文官利益集团不断败坏国事。
到天启皇帝病逝时，新上任的崇祯皇帝在文官的怂恿下，扳倒了了着名大太监魏忠贤的同时，也差不多完全摧毁了厂卫系统，导致皇帝对文官集团再无任何监控和压制力量，厂卫沦为“大汉将军”，几乎彻底失去反贪、监视、情报收集等一切职能，直至南明灭亡也无力恢复。
厂卫是明代特务政治的工具，是国内外情报系统的主要组成部分，是皇帝整顿吏治和防治腐败的机构。有明一代，一直存在。】
大秦
嬴政看到明朝的内阁制度啧啧称奇，内阁辅臣只向皇帝服务，提供咨政等决策，纵然后期发展权力再大，也是在皇帝之下，且皇帝可以随时裁撤，这可比容易失控的宰相制度要强很多了。
他倒是觉得，这个制度可以借鉴，如果将来某位皇帝英年早逝，留下幼子该如何？
权相、外戚争权夺利，幼帝失怙，无依无靠，怎么能夺回属于自己的权力呢？
这对于嬴政而言可就再清楚不过了。
“这厂卫制度监察天下，为皇帝鹰犬罢了，天幕上的这个崇祯皇帝自废爪牙，大明岂能不亡乎？”
嬴政看到朱棣设立的厂卫制度，和他大秦的雁冰台有相似的职能，只属于皇帝的特务机构。
因此也十分熟悉这套机构的运行，所以，对于朱由检的蠢操作也是一笑。
大唐
“越是王朝末年，皇帝与朝臣的权力争夺越是紧张，这个崇祯皇帝莫非被猪油蒙了心智，居然自废武功？”长孙无忌看到天幕上皇帝权力延伸的两个机构，居然被皇帝自己给废了，有些难以置信。
“刚才天幕上有简单提及过这位崇祯皇帝，想来并不是什么昏庸之君，这是此举异常，我等也不好判断。”杜如晦道。
“也许是如汉太宗般宗室入大支吧。”房玄龄猜测道。