燕王朱棣入京，文武百官，多迎谒马前。兵部尚书茹瑺，先至燕王马前，叩头劝燕王登基。
燕王朱棣问道：“少主何在？”
茹瑺道：“大内着火，想必少主已晏驾了。”……
朱棣看着眼前黑压压拜倒的人群，心内感慨万千！他原本心有异心，但并无反意。命运之中仿如有一只无形之手，将他带至南京，眼前便是一条金光大道，直入九天……
其时，朱棣最想见的反而是予他最大帮助的锦衣卫的缔造者，出身鬼谷门的卫国公主朱瑛。但人群之中无她！当他眼前的直面九王至尊之时，他忽然心生迷惘，恍如隔世。
群臣固请燕王即刻登基，而燕王朱棣再三固辞。
随着街上的马蹄声响，一位身着锦衣卫飞鱼服的秀气少年纵马而来。燕王朱棣眼前一亮，忙命人让那锦衣卫的秀气少年上前。
这人正是王九。当日，他又至公主府上，向公主朱瑛指了指桌上的一个锦囊，要他即刻将此锦囊交予刚刚入城的燕王。王九明白此事事关重大，急忙纵马前往。
王九将锦囊献上，转身便离去。
燕王朱棣打开锦囊，上书两个娟秀的两字“谒陵”。燕王朱根恍然大悟：“靖难”，依明太祖朱元璋《皇明祖训》“朝无正臣，内有奸逆，必举兵诛讨，以清君侧。”而“靖难”已毕，应谒陵方可！
燕王朱棣抽了自己一嘴巴子，马上移驾谒陵，一面令诸将守城，大索齐泰、黄子澄、方孝儒等，悬赏通缉而不提。
无人知晓当晚燕王朱棣谒陵，在自己父亲陵前谈了什么，唯有知晓的是第二天，他的眼睛是红通通的，如兔子的眼睛一般……
谒陵之后，燕王朱棣遂诣奉天殿即皇帝位，受诸王大臣朝贺，荣登大宝，终成孤家寡人！
但当朱棣在登基后，找到了一道圣旨，看到圣旨后失声痛哭。这却是皇侄朱允炆所留，上面写着他下的命令，大意是不要伤害四叔，他不是有意的，四叔并不是真心造反，你们不要伤他……
至此，燕王即位，年号永乐。
清宫三日。灰烬中找出建文帝的尸首，满身焦烂，四肢残缺，只觉惨不忍睹……燕王以天子礼敛葬。
该杀的杀，该赏的赏。
永乐帝朱棣杀伐决断。
方孝儒宗族亲友，及门下士连坐被诛十族。齐泰、黄子澄磔毙。兵部尚书铁铉，即在济南城上立明太祖神牌，而令燕王投鼠忌器的狠人，磔毙……
此前战死的将士，尽行追封。周、齐、代、岷四王，统复原爵，各令归国……
靖难之役最大的功臣为李景隆，封太子太师，赐功臣勋号，加柱国，增岁禄，列于群臣之首。
永乐帝朱棣终于有空，微服至京城东南一角卫国公主朱瑛的府上。卫国公主朱瑛本不愿住于皇宫内，明太祖时府邸原本只是偏居一隅，而从未改变过。
朱棣微服至卫国公主府上，朱瑛得知忙前来相迎，并款款下拜。
朱棣大手连忙扶起自家妹子，道：“若非你相助，俺哪能四年便可顺利打至南京，可是折煞你家兄弟啦。其实论此次‘靖难’，俺觉得，最大的功臣反而是你！”