双后腰的选择上，法布雷加斯与马蒂奇的搭档是穆里尼奥的神来之笔。法布雷加斯从马塔罗俱乐部青训营起步开始学踢球，10岁时加入巴塞罗那的拉玛西亚青训营。他的偶像是前巴萨队长瓜迪奥拉，效力青年队时曾与梅西、皮克一同踢球。尽管他曾为巴萨青年队一个赛季打入30多球，不过主要还是踢防守型中场的位置，未曾代表巴萨一线队出场。
2003年9月，法布雷加斯与阿森纳签约。10月末阿森纳联赛杯主场点球大战10-9击败罗瑟勒姆联队，16岁零177天的小法迎来职业生涯首秀，成为队史最年轻一线队出场球员。12月初联赛杯1/8决赛中，法布雷加斯打入职业生涯处子球，帮助阿森纳5-1大胜狼队，他也就此创造阿森纳队史最年轻进球纪录。
2003-04赛季英超，阿森纳以不败战绩夺冠，不过法布雷加斯并未在联赛登场，没能获得奖牌。2004-05赛季社区盾杯，法布雷加斯首发出战87分钟，阿森纳3-1击败曼联夺冠。征战英超首个赛季法布雷加斯就成为球队中场绝对主力。2006年夏天，阿森纳迁入酋长球场，法布雷加斯改穿维埃拉转会尤文图斯后留下的4号战袍。
他很快成为球队中场的攻防转换枢纽，与吉尔伯托·席尔瓦的组合较好填补了维埃拉留下的空缺，。2006-07赛季欧冠资格赛，法布雷加斯首次在欧战中梅开二度，帮助阿森纳3-0击败萨格勒布迪纳摩，总分5-1晋级正赛。2006年10月，他在合同期还剩6年时，就与阿森纳再续约5年球员透露温格执教阿森纳的比赛风格是他选择长期效力的原因。
2007年联赛杯半决赛，法布雷加斯率队淘汰热刺，决赛中阿森纳1-2不敌切尔西，无缘冠军。英超联赛法布雷加斯保持38轮全勤，送出11次助攻，与鲁尼并列全英超第一。法布雷加斯入选欧足联年度最佳阵容，被评为阿森纳赛季最佳球员，
2007-08赛季，随着头号射手亨利以及功勋副主席戴恩离队，法布雷加斯的表现成为球队战绩的风向标。他连续两年获得PFA年度最佳球员提名，并赢得PFA年度最佳新秀奖，首次入选PFA年度最佳阵容，还被官网球迷评为阿森纳年度最佳球员。
2008年11月，法布雷加斯接替威廉·加拉，首次担任阿森纳场上队长。阿森纳开局欠佳，随后战绩反弹重返争冠行列。在12月1-1战平利物浦一役，法布雷加斯与阿隆索碰撞导致膝盖受伤，缺席长达4个月之久。失去主心骨的阿森纳赛季末四大皆空，欧冠虽杀入半决赛，但两回合遭曼联双杀出局。
2009-10赛季，]全赛季各项赛事小法出战36场，打入19球助攻19次，创生涯单赛季进球纪录，进球助攻都差点达到20次以上，赛季末PFA年度最佳球员评选中他不敌鲁尼，不过入选了PFA年度最佳阵容。
2010夏天，阿森纳拒绝了巴萨针对法布雷加斯的3500万英镑报价。
2010-11赛季，阿森纳发挥上佳，直到2月仍留在四线争冠的行列中。然而2月末联赛杯决赛阿森纳爆冷1-2不敌伯明翰错过冠军，成为赛季转折点。该赛季阿森纳联赛排名再次跌至英超第4后，法布雷加斯决定转会离队。他各项赛事总计为阿森纳出战303场，打入57球助攻96次。
2011年8月，阿森纳接受巴萨报价，出售队长法布雷加斯。为了重回故土，西班牙中场接受每年从工资中支出100万欧元补贴到转会费中作为补偿条款，交易总额3500万英镑。回归巴萨首个赛季，小法出场48次，打入15球助攻20次，连夺四项冠军。