郑琦的水军经过一段时间的发展，如今已经颇具规模。这支水军拥有各种大小战船一百多艘，人员约有一万余人。然而，为了掩人耳目，他们对外宣称自己是护国军水师团。
随着郑琦的水师团加入，护国军的实力得到了进一步增强。至此，护国军已经拥有了三个团的兵力。不过，单就水师的人数而言，郑琦的水师团远远超过了黄祥的一团和孙临的二团的总和。
在这支水师团中，有二十艘主力战船尤为引人注目。这些战船是张好古亲自参与设计的，他将其命名为驱逐舰。这种战船规模庞大，大小约两千料，长度达到了三十丈，宽度则有五六丈之宽。为了提高战船在航行中的稳定性，张好古还特意在船身两侧添加了减摇鳍。
这些驱逐舰的设计十分精巧，两层主甲板上共装备了四十多门火炮。其中，船首的主炮重达五千多斤，威力惊人。经过张好古、王徵和孙元化等专家的不断改进，这门主炮不仅威力更加强大，而且还增加了炮座，可以实现上下左右的灵活调动。不仅如此，就连那些较小的火炮也具备了同样的可调动功能，大大提高了战船在战斗中的灵活性和火力覆盖范围。
在此期间，水师团经历了实战的洗礼，那便是在宁波外海的剿匪行动。在这场激烈的战斗中，那些穷凶极恶的海匪们要么被彻底消灭，要么吓得远走高飞，再也不敢在这片海域兴风作浪。
郑琦水军，对外号称“护国军水师团”，它可是护国军海上力量的核心所在。这支强大的水军之所以应运而生，正是为了应对东南沿海日益猖獗的匪患以及来自外部敌人的侵扰。水师团与黄祥、孙临统领的陆上军团紧密配合，形成了一套完善的海陆协同作战体系。如此一来，他们的总兵力超过了万人，其名称中的“护国”二字，不仅意味着保卫国家的海疆，更传递出一种抵御外侮的坚定政治宣言。
水师团的装备堪称精良，拥有大小战船百余艘，其中最为引人瞩目的当属那 20 艘“驱逐舰”。这些“驱逐舰”每艘都有两千料的排水量，堪称水师团的主力战舰。除此之外，还有快速哨船、补给舰等各类辅助舰艇，共同构成了一支强大的海上舰队。
在指挥体系方面，水师团采用了“团-营-连”三级架构，确保了指挥的高效与灵活。而士兵们大多是从闽浙沿海的渔民中招募而来，他们熟悉海洋环境，具备出色的水上技能。至于军官队伍，则由郑琦和召来的原水师军官以及西洋火器专家组成，他们不仅精通海战战术，还对先进的火器运用有着深入的研究。
这艘主力舰长约 96 米，宽约 19 米，如此巨大的船体在波涛汹涌的海面上行驶，就像一座移动的堡垒。为了提升稳定性，它还配备了先进的减摇鳍系统，使得船只在恶劣海况下也能保持平稳。
船的上层和下层甲板都装备了 40 多门火炮，其中最引人注目的是船首的主炮，这门主炮重达五千斤，而且可以 360 度旋转，能够灵活地应对来自各个方向的敌人。
孙元化、张好古、王徵等一批优秀的技术专家，引入了佛郎机炮的改良技术，并设计出了模块化炮座系统。这种系统不仅可以实现火炮的仰角和水平双向调节，还大大提高了射程和精度，超越了同期水师装备的火炮。