此后数年间，事变叠出，先是太子朱标于二十四年从西北还朝后生病，次年病殁，三年后秦王朱也死于古城。
待到洪武三十一年，晋王朱也突然病逝，至此太祖朱元璋三位年长的儿子全部去世，燕王朱棣成为诸王中最长者，也成为强藩之首。
洪武三十一年闰五月，太祖朱元璋病逝，皇太孙朱允即皇帝位，是为建文帝。
为防止藩王势力过大，朱允有兵部尚书齐泰、太常卿黄子澄主持下制定了削藩之策。
削藩所指自然就是势力最强的燕王。
但是齐、黄等人又恐燕王势大，不易对付，于是想到了从燕王同母兄弟周王朱下手。
当时黄子澄说道：“燕王性豁达果断，
尝难其举动，沉静深远，莫测其端倪，恐未易去，一发不成，大事遂去。莫若发自周王，周王易与尔。伺去周王，可以觇之，且令议周王罪，周王其同母弟也，必来救，救则可以连坐。周王既去，则其势孤立，僻处一隅，危如累卵，谁肯从之?此时虽有圣智，不能为矣”。
朱是个多才好学的藩王，但也颇有些恃才妄为，他知道建文朝廷对藩王有所防范，自己也作了些防备，于是渐渐有人传言他心怀异谋。
王府长史王翰是个有心计的人，看出建文朝廷的意图，一再劝朱小心为好，朱却只当耳旁风，从来不放在心上。
王翰恐怕日后祸及己身，佯狂而去。
朱的次子汝南王是个不逞之徒，一心想袭封周王爵号，将父兄视为眼中钉。
他知道朝廷有削藩之谋，便乘机出首告变。
这当然正是朝廷方面求之不得的机会，于是密命曹国公李景隆佯作北上备边，兵临开封，突然包围周王府，将朱逮送京师，谪遣到云省蒙化。
当时的云省，素有“烟瘴”之称。
这已经是周王第二次谪遣云省了。
这一次不比前次，那是朱元璋为教育儿子，望其向好，这一次却是朝廷论罪，削夺为庶人。
周王朱与王府家人，一路之上，只有看押军士的呵斥，一群昔日娇生惯养的皇亲国戚，竟然体无完衣，妻子冻饿，来到云省又恰恰有幼子初生，没有乳母，只得买头奶羊，以供哺乳。
想起王翰当初的劝谏，悔之已晚。
不久，朝廷又将朱召归京师，禁锢于高墙之中。
其后不久，燕王朱棣起兵“靖难”，并于建文四年六月兵入京师，当时宫中火起，建文帝朱允不知所终。
燕军攻入京师后，首先要做的一件事，便是命令骑士们迅速赶去护卫被拘系的周王朱和齐王朱。
正处拘系中的周、齐二王此时已经得知燕师兵临城下的消息，他们在惴惴不安地等待着燕师的到来。
大队全副武装的骑士们赶来时，周王朱还以为是建文帝城破前派来的杀手，不免失声惊呼，以为必死无疑。
后知是兄长燕王朱棣派来保护自己，方才惊魂初定。
周王朱直到被护送入燕军军营见到朱棣，这样情形下的相见，使这对同父同母的兄弟不禁相对而泣。