同一年，郭子兴病逝，朱元璋没能重掌军权。
各地红巾军的共同领袖，北方红巾军首领、小明王韩林儿任命郭子兴的儿子郭天叙为都元帅，妻弟张天佑为右副以朱元璋为左副元帅。朱元璋并非名义上的一把手，但因他有勇有谋，手下人才济济，且几乎所有军队都他招募收编而来，所以这支队伍的真正话事人，是朱元璋。他采用的策略是高筑墙、广积粮、缓称王，韬光养晦，低调地扩张实力。
公元1356年3月，张士诚在长江三角洲地带进攻江南元军。朱元璋抓住机会，率水陆三军进攻集庆，招降三万六千余人。为稳定降军军心，朱元璋从中挑选五百名勇士担任亲军，负责担任自己的守卫，以示用人不疑，疑人不用。由此军心归附。
朱元璋改集庆为应天府，设天兴建康翼大元帅府，以李善长为左右司郎中，下令安抚百姓。 小明王韩林儿收到捷报，擢升朱元璋为江南等处行中书省平章。在此后几年时间，朱元璋以应天府为根据地，渐渐控制了江苏、浙江一带，坐拥十万精兵。
公元1360年，刘伯温来到应天府，成为朱元璋的首席谋臣。至此，朱元璋的开国三杰李善长、刘伯温和徐达全部集齐，“大人虎变，未占有孚。”他在辖内地区兴修水利，开垦种田，动员百姓从事农业生产，同时推行屯田法，大力开展军队屯田。短短几年时间，府库充盈，军粮充足。
本小章还未完，请点击下一页继续阅读后面精彩内容！在广积粮、得民心的同时，朱元璋在应天府修建礼贤馆，专事网罗天下人才，尤其是儒生和读书人。他已经在为开创一个新的王朝提前做准备。
此时，朱元璋开创王朝最大的拦路虎，除了依然盘踞大都的老旧元帝国外，就是雄踞长江上游的陈友谅，和长江下游的张士诚，余者皆不足为虑。所谓“君子豹变，小人革面，”张士诚据守高邮称王，善待百姓而民心归服；陈友谅则诛杀徐寿辉后自立为帝，横征暴敛，兵力强盛。
雄心勃勃的陈友谅暗中结盟张士诚，试图东西夹击应天，平分朱元璋的领地。朱元璋召集众将商议之后，采纳刘伯温的计策，决定弃张士诚于不顾，集中兵力消灭陈友谅。
这么做的理由是，陈友谅为人激进，若攻打张士诚，他一定会起兵支援，而张士诚为人保守，若起兵攻打陈友谅，他可能会死守高邮，坐山观虎斗。而陈友谅刚刚弑君自立，部众离心，人民疲敝，貌似强大却不过是一只纸老虎。
朱元璋攻略陈汉的战争“征凶，居贞吉，”战事一度处于极度胶着状态。朱元璋的军队最终以火攻陈军，取得最后胜利。
在休养生息一年后，朱元璋起大军覆灭张士诚，随即命徐达、常遇春率军二十万北伐中原，兵进大都。
公元1368年正月，朱元璋在应天府称帝，国号大明，是为明太祖。
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