如果让船教在南方联军的地盘传开，被当地人接受，李彼得就要面对数以万计的狂热教徒，付出巨大的损失。他当机立断，顾不上休整部队，消化战果，全力对南方联军发起进攻，誓要在船教这颗毒瘤扩散开之前，统一西大陆。
为了阻止船教的扩散，李彼得开始在己方控制区宣传船教的害处，让人们远离船教，但是地方的控制区他就管不到了。无奈之下，他只能打到哪儿，宣传到哪儿。
到了后来，他不但宣传船教的害处，还鼓励民众举报船教信徒，成功举报一人，就能得到5000元乐园币的奖金。在奖金的诱惑下，人们开始四处搜捕船教信徒。凡是敢宣讲或是传播船教教义的人，全部会被当场逮捕，扭送到驻防部队或是附近的野战部队去。
不过由于扩张速度太快，驻防部队和野战部队严重不足，宣传和抓捕的效果越来越差。到了2044年6月，新占领的地区已经开始出现船教教徒暴动。对此，李彼得毫无办法，只能哪里暴动就镇压哪里，能抓多少人就抓多少人。
船教和南方联军的同盟，无法改变南方联军灭亡的命运。这是因为李彼得的进攻速度太快，海运又太费时间，而且需要港口，还需要再进行陆路运输。
李彼得早已经针对这一情况，派部队优先占领或摧毁南方联军的港口，让船教没法把装备送过来。就算有装备送过来，运输队也会遭到北方军空军的打击。这就导致南方联军补充装备的速度大大减慢，根本顶不住北方军的凶猛攻势。
到了2045年8月，南方联军已经不剩几块地盘。部队倒是还有三四十万，但大部分都在深山老林里和北方军打游击。因为得不到后勤支援，这种游击战根本持续不了多久。
仗打到现在，西大陆可以说是大局已定。然而李彼得想要彻底统一西大陆，还需要不少的时间。最大的问题还是南方地区的船教徒，这群疯子潜伏在人群之中，暗中宣讲船教教义，等教徒聚集到一定规模，就开始在当地搞破坏，制造恐慌，然后把责任全部推到北方军身上，顺势拉拢更多的人入教。
渗透到北方的船教间谍也是个大问题。从2045年7月开始，船教就开始往北方输送小股的特种部队。他们在间谍的配合下，四处破坏，在后方造成了很大的混乱。
除了派特种部队对付船教的特种部队，并不断加大对船教的打击力度之外，李彼得已经想不到任何办法。
按照李彼得本来的计划，在击败南方联军之后，他就能得到南方联军的舰船。有了足够舰船，他就有了跨洋作战的能力。只要筹划两到三年，他就能进军东大陆。
然而因为船教的加入，南方联军在战败前，其海军已经被船教尽数接收，北方军一艘船也没捞到。北方军现在海军贫弱，无法执行跨洋作战。
发展海军是需要时间的，在船教不断捣乱的情况下，想要把海军发展起来不是件容易的事。所以现在李彼得只能全力清剿西大陆上的船教徒，在稳定了内部局势之后再作打算。
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