一直以来，孟浚都密切的关注江宁常州这方面的情报，不止孟必安主要精力投入其中，孟浚发动士绅，还有投靠自己的明朝官僚，刺探江宁各地的虚实，几乎隔上几日，就有情报传递而来。
孟浚经过情报之间的交叉比对，认为在江宁的绿营兵接近四万人，而镇江驻军五千，常州驻军两万，而无锡方面，离苏州过近，洪承畴不在无锡驻军，甚至抽走绿营，已经事实上抛弃了无锡城，而一些探报则表明清廷已经在准备组建水师。
多尔衮知道，在南方作战，没有水军必然会受制于人，因此，经过筹划，最终选择在安庆建立水师，并交由耿仲明负责整编训练。
安庆地处长江流域，拥有得天独厚的地理条件，非常适合发展水师力量。这里水系发达，港口众多，清廷则对这支水师寄予厚望，希望它能成为平定南方叛乱的重要力量，不过就此时而言，这些小舰板只能说聊胜于无罢了。
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正所谓磨刀不误砍柴工，从回师苏州以来，孟浚就在苏州展开轰轰烈烈的大练兵，至今已有半年之久，趁着难能可贵的战事空窗期，孟浚要让新组建的武宁，武兴，固武三镇，从杂乱无章之军，蜕变成精锐之师，而长林及宁武二镇，已成立许久，都经历过战火的洗礼。
孟浚以现代军训之法，配合戚继光《纪效新书》的练兵之道，在孟浚的完善下，重新编辑孟军诸镇的练兵操典，命林士奇，为全军练军总官。
在孟浚看来，任何一支精锐之师，其军队的核心，便是军法，纪律，奖励，还有惩罚，在新编的练兵操典中，除了一些带有现代化特色的负重跑步，军姿队列外，孟浚大部分采用了戚继光的《练兵纪要》，若论起来，在军队的具体操作层面上，确实没有比《练兵纪要》更为详细的兵书了。
军队也是由一个一个的士兵组成，依然逃不开衣食住行四个方面。
孟浚从起兵之时就注重军容，人靠衣装马靠鞍，孟浚尚黑，所以孟军之中，所有的衣甲，皆为黑色，在会操之时，成千上万的黑衣黑甲，如同一片黑色的海洋般，极为具备强大的视觉冲击力。
而食物方面，孟浚规定所有军官，无论级别高低，在军中，必须和士兵的伙食一般无二，与士卒同甘共苦，一方面可以拉近将士的关系，而另外一个重要的原因，便是军官可以和士卒一样的营养，随时感知士卒的身体状况。
而在住的方面，基于孟浚当初早在军镇初创时，立下的那些奇奇怪怪的规定，在卫生方面的要求，可以说是严苛了，在军中随地大小便，首犯十鞭，二犯三十鞭，三犯八十鞭，还有其他的一些细节条例，这让士卒们都有些难以忍受，便是军官也觉得太过苛刻。
不过将士们更讨厌的是新组建的军法处，以及处长武进坤。
武进坤，苏州锦衣卫出身，孟浚攻克苏州时，他正在监狱之中，孟军入城，正好救了他一命，而他当即决定投奔孟军。