在孟浚的设想中，都督府组织架构，上设参赞部，下设吏政司，民政司，军政司，宣传司，律政司，匠作司，几乎是大明朝内阁和吏户兵工礼五部的变种。
而仅靠孟浚自己想要完成都督府编制，实在是太过繁琐，想到此，孟浚对着门外的俞安喊道：“去请慕德，顾先生，还有张博他们都请来”
“是都督”随后一阵急促的脚步声由近及远。
随着杨恩和顾炎武诸人急匆匆的赶来，孟浚先是让人倒了几杯茶，道：“先喝口茶”
喝了口茶，杨恩率先开口道：“都督，不知有何急事”
“我深思熟虑后决定对都督府进行体制改革，原先所有一切都是围绕着军队展开的，但现在情况已然不同。我们如今坐拥如此广阔的领地，已不再是那个只有苏州一城之地的时期了。当前面临诸多问题，如税收、官吏治理、法律法规、海外贸易、钱粮分配等重要事务都缺乏明确的负责人来管理，如果没有规章制度，那必然会陷入混乱。”孟浚目光注视着眼前的几个人，郑重其事地说道。
杨恩听后，表示赞同地点点头，回应道：“确实如此。”他深知规范管理对于一个势力的重要性。
顾炎武闻言开口道：“都督，何不如以朝廷旧例，若是改之，我怕人心浮动”
张博听到顾炎武的话，表示反对，摇摇头道：“朝廷旧例，怎么改，总不能也弄兵部户部吧”
“倒不是这个意思，我的意思是都督府改制可，不变地方之制，若变，一方面必要宵小置疑都督之心，第二也怕地方百姓不安”顾炎武缓缓的说道。
在场的每个人都开始各抒己见，畅所欲言地参与到这场热烈的讨论之中，有时会因为意见不合而争论得面红耳赤，但更多的时候则是在互相探讨，就这样，时间一分一秒过去了，整整一天过去了，然而众人却浑然不觉，直到入夜，都督府新制方才出炉。
都督府作为一个庞大而复杂的机构，其内部设有多个部门以实现全面管理。其中最重要的当属参赞部了，它犹如都督府的大脑一般起着关键性作用，如大明朝廷的内阁一般。
参赞部下辖有五个司职部门：首先是吏政司，这个部门负责管理官员们的职务升迁与降职等事宜，可以说是各司之首，其次是民政司，其职权范围广泛，包括钱粮的征收、物资的调配供给等事务，接下来是军政司，所有军事行动都必须经过该司的批准才能实施，同时他们还掌管着各地驻军以及各镇步兵和水军，宣传司，顾名思义这是一个专门负责宣传工作的部门，最后还有律政司，主要任务是监督检查各级官僚并处理相关法律事务，至于匠作司，则专注于武器装备的制造生产。
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