而黄应杰一逃，其部下很快便溃散而逃，两千人除战死受伤的七八百人，被俘近千人，余者溃散一空。
这千人俘虏则被李成栋一声令下，全部斩首以震慑大军，不过这样一来，军中几乎毫无士气，被杀的很多人都在军中有相熟之人，李成栋军中暗流涌动，军士不稳之气，溢于言表。
这一场内讧，死伤人数上千人，而更重要的是，因此战松江城的士气跌入谷底，原本李成栋便对守住松江城信心不足，这下子，更加毫无战意了，看着夜幕下的松江城，李成栋暗下决心。
两日之后，孟浚的前锋斥候抵达松江城，令张成盛有些意外的是，竟然没有清军的哨骑过来阻拦，怀着有些不安的心，张成盛抵进了松江城外，只见松江城门洞开，张成盛抬眼望向门洞内，横七竖八的躺着一些人，不知是死是活。
两名斥候壮着胆子下马，慢慢的摸进城门，一进城内，瞬间便被惊呆住了。
只见城内尸横遍野，满目疮痍，一眼望去，视目可及之处，大量的房屋都已烧塌，一片狼藉之象。
虽说松江城不是什么大城，但城内也有民众两万余人，李成栋令士卒搜刮城中民财，每家每户都被搜刮一空，当士卒尝到好处后，更加的无法收手，而李成栋也无意甚至是有些放纵兵士劫掠，不到一天的时光，松江城内明面上能翻找出来的财货，基本上已经洗劫一空，但这些绿营兵毫无罢手的迹象，开始拿起刀枪，严刑拷打平民藏起的财物。
而这时候杀戮也渐渐的多了起来，侮辱妇女这种事更是止不住了，愈演愈烈下，很快便彻底放开，最后演变成屠城，杀戮声，哭嚎声，惨叫声，响彻了松江城。
甚至到了最后也不知道是谁最先开始放火焚城，就连李成栋的住所都被波及到，李成栋有些狼狈的逃出松江城，火焰冲天，李成栋逐渐收拢士卒，屠城一日，军中的士气肉眼可见般恢复，而李成栋看也不看城内的惨状，似乎和自己没有一点关系，随即率军撤往杭州。
而屠城后的第三天，孟浚才姗姗来迟，看着几乎已成空城的松江城，惨烈的景象，令孟浚痛心疾首，孟军抵达松江城后，光是清理尸体就花了两天的时间，而就在孟浚考虑在松江上海县重建水师时，一个噩耗传了过来，看着这个消息，孟浚久久无言。
明弘光元年，隆武元年，公元1645年八月二十一日，坚守近三月之久的江阴城沦陷了，阎应元被抓后不屈被杀，家中老小皆不愿投降清军，一同被杀。整个江阴县衙43人举火自焚。而阎应元坐在东城敌楼，留下了一首流传千古的绝命诗：
八十日带发效忠，表太祖十七朝人物
十万人同心死义，留大明三百里江山
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