被李傕，郭汜压制的东汉属臣也动了心，谏议大夫种邵、侍中马宇、左中郎将刘范愿意在长安为韩、马作内应。
结果消息泄漏，这几个人没有办法和兵屯长平观的韩、马联系，只好跑到槐里。而在长平观的韩，马却被樊稠、郭汜打的大败，跑回凉州。
这时的马超已经18岁了，此役随父亲狼狈逃回，毫无半点演义中的风采。
四，毫无义气与结义兄弟内讧。马腾虽然被樊稠、郭汜打败，可李傕趁这次机会除掉了拥兵自重的樊稠，接着又借皇帝之口赦免了马腾、韩遂。
返回乡里的马腾和韩遂并不安分，两人互相攻战。典略上记载，两人先前的结义兄弟之情继而反目荡然无存，马腾首先攻击韩遂，韩遂返攻马腾，还杀死了马腾的妻子和儿子。
结义兄弟至此，让人惊心动魄。魏略上记载，东汉建安元（196）年，在这次争斗中，韩遂的女婿阎行有次用长矛刺马超，没想到长矛折断，断矛头就在马超颈边飞过，马超几乎因此丧命。
直到司隶校尉钟繇和凉州刺史韦端，分别给韩遂、马腾两人写信相劝，争斗的两人终于罢兵，还都遣子入侍作为人质，封马腾为槐里侯。
五，首鼠两端继而助曹灭袁。东汉建安七（202）年五月，袁绍死。九月，袁尚所置的河东太守郭援，与高干匈奴南单于共攻河东，派遣使者和马腾等联系，马腾假装答应。
得到回应的郭援军一气攻下河东，而这时钟繇还在平阳围困南单于，城未攻下，却听说郭援马上就来，只好派遣新丰令张既向马腾求援。
马腾犹豫不决，这时属下傅干跟马腾说：“古人有言，顺道者昌，逆德者亡，现在曹公是奉天子之命，法明政治，上下用命，这就是顺道。
“而袁氏背弃王命，还勾引胡虏进攻中原，这可是逆德呀！如今将军已经归属曹公，却不尽全力，两头观望，只想坐观成败。恐怕到逆德者亡时，第一个掉脑袋的就是将军您呀！”
一句话点中心事，马腾才害怕起来。傅干接着说：
“不过这正好到了将军立功的时候，现在曹公全力与袁氏对抗，顾不上河东郭援。但如果将军出兵，内外击之，必能断掉袁氏一臂，解掉河东之急。而曹公必定感激将军，将军的功名就无可限量了。”
于是，马腾终于定下决心派马超率万余军进援钟繇，这是27岁的马超在正史中第一次正式出场。得到马超援军的钟繇，判断出郭援刚愎好胜，必定恃勇强渡汾水，定下趁郭援渡水将半时攻击的计策。
马超只是策略的实施者，不过也算是勇不可挡。战斗中虽被流矢所中，仍坚持作战，麾下的庞德则亲斩郭援。此战一举歼灭郭援，而南单于也投降，解掉河东之危。
东汉建安十（205）年，曹操派张既说服马腾出兵围剿张晟等人，不久，响应高干的势力都被马腾歼灭，这一年马超29岁。第二年，没有后顾之忧的曹操亲自攻下壶关。
六，归顺而有保留，留下祸根。东汉建安十三（208）年，平定河北的曹操踌躇满志进位丞相，为了去除南征的后顾之忧，准备收复马腾。
此时由张既游说马腾解散部队，移居许昌。马腾迫不得已答应，但是仍然有些犹豫不决。张既见状就大造声势，写信给马腾将经过的几个县，隆重准备接待事宜，又命令沿途俸禄在二千石以上官员出城郊远迎。